工程研究院是安徽工业大学直属单位。2011年3月，根据校党委会议决定以及人〔2011〕9号文件要求，学校撤销原工程研究中心，成立工程研究院。

工程研究院现有教育部冶金减排与资源利用重点实验室、现代表界面工程研究中心以及现代分析测试中心3个内设机构，下设综合管理部、项目开发与管理部及重点实验室管理办公室职能科室3个。研究院现有专职教工53人（含外教1人），其中正高7人，副高21人，博士33人，博士占比为63.4%。

工程研究院作为安徽工业大学科学研究与服务社会的综合平台，主要功能是依托学校学科优势，整合校内外优质科研资源，紧扣国家发展战略及地方经济与社会发展的需求，构建科研组织与平台，建设高水平研发团队，开展科学研究与技术创新，促进科研成果产业化，为社会经济发展做出贡献，同时支撑、推进学校学科建设与发展。工程研究院的建设与发展，对于加快学校内涵发展，提高学校科学研究与服务社会能力，加快社会创新体系建设具有重要意义。

工程研究院依据功能定位，以“五个平台”建设与运行为主要任务。

（1）科学研究平台。根据学校学科发展与科研需求，建设科学研究平台与高水平研发团队；依托学校、政府与企业，以服务产业为目标，构建产业技术研究院。

（2）技术创新平台。建设以服务行业为目标的创新研究平台，开展产学研合作，不断拓展社会服务领域和范围。

（3）设备共享平台。建设高水平公共分析测试平台，促进大型仪器资源共享，为学校教学、科研服务，同时为社会提供高质量分析测试服务。

（4）成果转化平台。建设集科研成果鉴定、发布与中介服务为一体的综合性成果转化平台，通过合作、授权、转让、入股、创办企业等形式，促进科技成果转化。

（5）人才培养平台。利用科研平台和科研项目，通过研究生培养，为社会输送高层次工程技术人才。通过项目合作形式，为行业和地方企业培养应用人才。

目前，工程研究院负责安徽工业大学科技园有限公司、安徽工业大学信息技术研究院（公司）、安徽工业大学宣城工业技术研究院（公司）、安徽工业大学和县化工产业发展研究院（公司）、安徽工业大学智能装备技术研究院（公司）以及安徽工业大学芜湖技术创新研究院的运营与管理。